Vorweg: ich kenne dein Notebook & eventuell auftretende Probleme leider nicht.
Ich vermute mal du meinst diese Wlp von Conrad
http://www.conrad.de/goto.php?artikel=189070 , weil deine Verlinkung führt leider ins Leere.
Wirklich große Unterschiede sollte es von der Wlp her ansich nicht geben, vor allem nicht bei den relativ geringen Verlustleistungen. Außer eben hinsichtlich der Einfachheit der Anwendung und eventuell der elektr. Leitfähigkeit.
Ich könnte mir höchstens vorstellen, dass
a) entweder, wie du schon gesagt hast, die Kühlmöglichkeiten ohnehin ausgeschöpft sind oder
b) der Anpressdruck, ggf. wie vorher auch schon, nicht ideal ist. Möglicherweise könntest du durch verschieden dicke Kupferplättchen dann mehr erreichen (sofern dann andere Bereiche wie GPU/CPU durch mehr Anpressdruck besser gekühlt werden).
Aber das sind reine Vermutungen - die Frage ist auch immer, ob einige Teile, wo vorher Wärmeleitpads waren, denn wirklich gekühlt werden müssen - ich habe die Vermutung, dass das manchmal auch eher als Abstandshalter/Polsterung benutzt wird.
Leider schwächen solche Mehrfachauflagen oft erheblich direkten Anpressdruck auf GPU & ggf. auch CPU, je nachdem, wie deine Kühlvorrichtung aufgebaut ist.
Kannst ja mal schaun, wie die Wärmeleitpaste an den wesentlichen Stellen anch der Montage & Betrieb verteilt ist, und ob dort wirklich guter Kontakt vorhanden war.