Die xorg.conf die du ändern musst ist die in /etc/X11. Mir scheint sie aber korrekt zu sein.
Mit sax kenne ich mich aber kaum aus, daher weiß ich nicht, ob die in /var/lib/sax auch ausgewertet wird.
Der externe Monitor scheint ja richtig konfiguriert zu sein, nur falsch angesteuert zu werden. Ich vermute, dass das interne Display die Auflösung beschränkt, denn das kann ja nicht mehr als 800 Pixel vertikal.
Kannst bitte mal mit Fn + F3 (evtl. mehrfach drücken) auf den externen Monitor als alleiniges Display umschalten? Vielleicht wird dann die Auflösung korrekt eingestellt. Falls nicht, schalte den Desktop mal vom geklonten in den erweiterten Modus um und beobachte was passiert. Das funktionierte bei mir unter Suse 10.3 mit 1280x1024 problemlos. Mit geklonten Desktops habe ich mich damals nicht beschäftigt.
In etwa einer Woche könnte ich es mal mit Suse 11.1 (ob ich 11.0 noch irgendwo habe weiß ich nicht) testen, falls dein Problem dann noch besteht.
Welchen Desktop verwendest du? KDE, Gnome oder noch was anderes?